MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Fervidicoccus fontis Kam940 chromosome

Total Repeats: 4619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017461	CTT	2	6	1267657	1267662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_017461	GAA	2	6	1267672	1267677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_017461	AATA	2	8	1267700	1267707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_017461	CCT	2	6	1267882	1267887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_017461	TGTT	3	12	1268427	1268438	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_017461	TAT	2	6	1270792	1270797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_017461	A	6	6	1270815	1270820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_017461	ATT	2	6	1270889	1270894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_017461	AAT	2	6	1270974	1270979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_017461	CAA	2	6	1271004	1271009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_017461	TTTATA	2	12	1271024	1271035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_017461	TAA	2	6	1274034	1274039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_017461	T	7	7	1274360	1274366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_017461	TCA	2	6	1275469	1275474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_017461	TTA	2	6	1275601	1275606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_017461	TCT	2	6	1275621	1275626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_017461	ATA	2	6	1275627	1275632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_017461	TTAT	2	8	1275634	1275641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_017461	GAA	2	6	1276056	1276061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_017461	AAG	2	6	1276074	1276079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_017461	A	6	6	1277362	1277367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_017461	T	6	6	1277384	1277389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_017461	AT	3	6	1277391	1277396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_017461	ATT	2	6	1277434	1277439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_017461	TGT	2	6	1277465	1277470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_017461	AG	3	6	1277485	1277490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_017461	TAAA	2	8	1279747	1279754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_017461	A	6	6	1279770	1279775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_017461	T	6	6	1279778	1279783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_017461	A	6	6	1279786	1279791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_017461	A	7	7	1279795	1279801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_017461	T	6	6	1279810	1279815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_017461	TA	3	6	1279853	1279858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_017461	GAG	2	6	1289786	1289791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_017461	CTC	2	6	1289823	1289828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_017461	ATGG	2	8	1289907	1289914	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_017461	GGAG	2	8	1289940	1289947	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_017461	G	6	6	1289956	1289961	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_017461	TC	3	6	1289989	1289994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4540	NC_017461	AG	3	6	1290027	1290032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_017461	A	6	6	1290037	1290042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_017461	AGGG	2	8	1290066	1290073	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_017461	A	6	6	1290180	1290185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_017461	GAG	3	9	1290257	1290265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_017461	AAG	2	6	1290289	1290294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_017461	G	6	6	1290319	1290324	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_017461	GAG	2	6	1290347	1290352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_017461	GCTT	2	8	1290353	1290360	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4549	NC_017461	GA	3	6	1290368	1290373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_017461	GCA	2	6	1290382	1290387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_017461	TAT	2	6	1290448	1290453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017461	CG	3	6	1292913	1292918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4553	NC_017461	CA	3	6	1292931	1292936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_017461	ATT	2	6	1292954	1292959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017461	T	6	6	1293020	1293025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017461	GTA	2	6	1293031	1293036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_017461	T	6	6	1293038	1293043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017461	AT	3	6	1293044	1293049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_017461	T	6	6	1293569	1293574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_017461	TAAT	2	8	1293614	1293621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_017461	TAA	2	6	1296605	1296610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_017461	ACT	2	6	1296660	1296665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_017461	ATT	2	6	1296705	1296710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017461	CTT	2	6	1298216	1298221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_017461	GAGGG	2	10	1298284	1298293	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_017461	GA	3	6	1298295	1298300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_017461	ATT	2	6	1298331	1298336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_017461	GTGA	2	8	1298343	1298350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_017461	ATT	2	6	1298357	1298362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_017461	CTG	2	6	1305623	1305628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_017461	GAC	2	6	1305629	1305634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_017461	ATT	2	6	1305679	1305684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_017461	GGAT	2	8	1305692	1305699	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_017461	ATT	2	6	1305704	1305709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_017461	ATG	2	6	1305715	1305720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_017461	CCA	2	6	1307732	1307737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4577	NC_017461	AT	4	8	1307758	1307765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_017461	CT	3	6	1307783	1307788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4579	NC_017461	AT	3	6	1307798	1307803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_017461	TCA	2	6	1307811	1307816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_017461	AAAT	2	8	1308823	1308830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_017461	GGT	2	6	1308836	1308841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_017461	CCT	2	6	1309122	1309127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4584	NC_017461	TTA	2	6	1309226	1309231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_017461	CAG	2	6	1309958	1309963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_017461	AATAA	2	10	1309970	1309979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_017461	AGA	2	6	1309987	1309992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_017461	A	6	6	1309992	1309997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_017461	TCT	3	9	1310003	1310011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_017461	A	6	6	1310353	1310358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_017461	T	6	6	1310362	1310367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_017461	TAA	2	6	1310380	1310385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_017461	T	6	6	1310392	1310397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_017461	CG	3	6	1310421	1310426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4595	NC_017461	GTC	2	6	1313874	1313879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_017461	TGG	2	6	1313907	1313912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_017461	CAG	2	6	1313919	1313924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_017461	T	6	6	1315620	1315625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_017461	G	6	6	1315651	1315656	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_017461	ACC	2	6	1315673	1315678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4601	NC_017461	TTGC	2	8	1316004	1316011	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4602	NC_017461	AGC	2	6	1316022	1316027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_017461	AGC	2	6	1316186	1316191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_017461	GAG	2	6	1316378	1316383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_017461	AGG	2	6	1316460	1316465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_017461	A	6	6	1316500	1316505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_017461	ACC	2	6	1316551	1316556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4608	NC_017461	ATT	2	6	1316871	1316876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_017461	CAA	2	6	1316880	1316885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_017461	AGA	2	6	1317706	1317711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_017461	T	7	7	1317771	1317777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_017461	CTT	2	6	1317905	1317910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_017461	GA	3	6	1318113	1318118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_017461	GAA	2	6	1318131	1318136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_017461	TAACAT	2	12	1318138	1318149	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4616	NC_017461	TAAA	2	8	1318949	1318956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_017461	TGAA	2	8	1318963	1318970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_017461	A	6	6	1319170	1319175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_017461	TC	3	6	1319186	1319191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.